Les nouveaux tests d'écouvillonnage COVID-19 sont-ils précis ?

Il y a d'abord eu l'annonce de l'opération "Moon Shot" et le projet de dépister jusqu'à quatre millions de personnes par jour. Ensuite, il y a eu les tests de masse à Liverpool, puis le déploiement des tests d'accès rapide dans les maisons de soins. Au cours de la même période, des dizaines de tests privés d'accès rapide ont été mis sur le marché.

Au début de la pandémie de COVID-19, le Royaume-Uni était très en retard en matière de tests. Le seul test disponible était le test PCR (réaction en chaîne de la polymérase), qui est toujours le test standard utilisé dans les sites d'analyse du NHS. Il consiste à prélever un écouvillon du nez et de la gorge, qui est envoyé à un laboratoire pour analyse. Au cours des premiers mois, il y a eu une pénurie mondiale d'écouvillons et de réactifs utilisés dans les tests de laboratoire pour le coronavirus. Cette situation a été résolue en quelques semaines, mais comme les tests PCR doivent être traités en laboratoire, il faut compter au moins 24 heures pour obtenir un résultat.

C'est pourquoi la recherche s'est fortement concentrée sur la mise au point de tests permettant de savoir plus rapidement si l'on est infecté. Plusieurs types de tests d'accès rapide, notamment les tests de flux latéral et les tests LAMP (loop-mediated isothermal amplification), ont été testés avec plus ou moins de succès.

Les tests d'écouvillonnage COVID-19 sont-ils douloureux ?

La plupart des tests visant à déterminer si vous êtes actuellement infecté par le COVID-19 impliquent un écouvillonnage du nez, de la gorge ou des deux. L'écouvillon ressemble à un coton-tige doux. L'écouvillonnage du nez peut être légèrement inconfortable et vous donner envie d'éternuer. L'écouvillonnage de la gorge peut provoquer un léger haut-le-cœur, mais aucun des deux tests ne devrait être douloureux.

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Comment fonctionne le test d'écouvillonnage du coronavirus ?

Test PCR

Le test PCR sur écouvillon consiste à prélever un échantillon et à isoler l'ARN (le code génétique) du virus - le virus COVID-19 est un virus à ARN. L'ARN est similaire à l'ADN (le code génétique de l'homme), mais il n'a qu'un seul brin, au lieu du double brin de l'ADN. La PCR ne fonctionne que sur l'ADN, mais les scientifiques peuvent utiliser des enzymes pour convertir l'ARN en ADN.

Cette copie unique d'ADN est convertie, par le processus PCR, en millions de copies. Cela prend :

• Enzymes pour favoriser les réactions chimiques.

• Éléments chimiques constitutifs de l'ADN.

• Cycles répétés de chauffage (pour séparer les deux brins d'ADN produits), de refroidissement et de création de nouveaux brins d'ADN.

• Le temps.

Le signal de millions de copies peut être détecté lors des tests. Il est clair que si l'ARN COVID-19 n'est pas présent, il ne peut pas être converti en ADN ou répliqué.

Tests d'accès rapide

Les tests rapides à flux latéral (LFD) ne sont pas seulement utilisés pour le COVID-19 - ils peuvent être utilisés pour tester l'urine, la salive, la sueur, les fluides et d'autres types d'échantillons et le test est couramment utilisé pour les tests de grossesse.

Pour les tests COVID-19, un "anticorps monoclonal" - qui correspond exactement au virus ou à une partie du virus - est fixé sur une bandelette spéciale dans une cartouche de test. Des extraits de l'échantillon d'écouvillon sont passés sur la bandelette, et si l'antigène COVID-19 est présent, il est détecté par l'anticorps et apparaît sous la forme d'une ligne colorée. Le test Innova, utilisé à Liverpool et dans les tests de masse des maisons de soins, est un test rapide à flux latéral.

Les tests LAMP (loop-mediated isothermal amplification) fonctionnent de la même manière que les tests PCR. Ils convertissent l'ARN viral en ADN et le copient. Cependant, ils utilisent des réactifs chimiques et la technologie LAMP plutôt que la chaleur : cela produit une quantité beaucoup plus importante d'ADN plus rapidement, ce qui entraîne un changement de couleur qui permet d'interpréter le résultat.

Quelle est la précision des tests d'écouvillonnage COVID-19 ?

Test PCR

Même le test PCR n'est pas précis à 100 %. Les scientifiques évaluent la précision des tests en se basant sur :

Sensibilité: fréquence à laquelle les personnes porteuses de COVID-19 sont identifiées comme étant infectées. Les personnes dont le test est "faussement négatif" sont infectées mais ont un résultat négatif.

Spécificité: fréquence à laquelle les personnes qui n'ont pas COVID-19 sont informées qu'elles sont infectées. Les personnes dont le test est "faussement positif" ne sont pas infectées par le COVID-19 mais obtiennent un résultat positif (par exemple, parce qu'elles sont infectées par un virus dont le code génétique est similaire).

Une étude suggère des taux de faux négatifs de 2 à 29 % pour les tests PCR, sur la base d'un test PCR négatif qui devient positif par la suite.

Une partie du problème réside dans la quantité d'ARN du virus présent - aux premiers stades de l'infection, il se peut qu'il n'y ait pas assez de matériel génétique pour un test positif précis, même si vous êtes infecté par le COVID-19. En moyenne, les personnes sont plus susceptibles d'être testées positives quelques jours avant l'apparition des symptômes et jusqu'à une semaine environ après le début de ces derniers.

Accès rapide aux tests

Le test PCR est l'étalon-or en termes de sensibilité et de spécificité, et tous les tests d'accès rapide sont comparés aux résultats du test PCR.

Public Health England (PHE) a testé 40 tests d'accès rapide à l'écouvillon COVID-19. Tous ces tests, sauf neuf, ont échoué au premier obstacle : ils présentaient des taux de faux positifs/faux négatifs trop élevés, ou un trop grand nombre de kits étaient défectueux.

Innova
Sur les 40 tests soumis à l'EPS, le test Innova LFD a été le premier à être adopté. Il s'est avéré avoir une spécificité de 99,6 % et une sensibilité élevée par rapport à la PCR.

OptiGene
Depuis l'approbation du test Innova, le Department of Health and Social Care (DHSC) a également approuvé le test OptiGene RT-LAMP. Ce test peut être réalisé à l'aide d'un écouvillon du nez ou de la gorge ou d'un échantillon de salive. Son rapport a montré que, comparé à la PCR, le test OptiGene RT-LAMP est plus efficace que la PCR :

• Le test OptiGene sur les écouvillons du nez et de la gorge avait une sensibilité de 95 % et une spécificité de 99 %.

• Le test OptiGene sur la salive avait une sensibilité de 79 % et une spécificité de 100 %. Cependant, chez les personnes ayant une charge virale plus élevée (celles qui sont plus susceptibles d'être infectieuses), la sensibilité atteignait 94 %.

LumiraDx
NHSScotland utilise LumiraDx - un test d'immunofluorescence microfluidique qui détecte directement la présence de protéines nucléocapside, utilise un écouvillon nasal et fournit un résultat de test COVID-19 en 15 minutes environ. Il est comparable aux tests PCR positifs dans 97,6 % des cas.

Abbott Panbio
Le²³ décembre 2020, à la suite de tests de phase 2 concluants, le test Abbott Panbio LFD a été comparé au test Innova dans le cadre d'une étude PHE pour la détection de la nouvelle variante COVID-19. Après avoir montré des résultats équivalents, il est utilisé dans des tests sur le terrain par le NHS.

SureScreen Diagnostics
Le¹¹ janvier 2021, le DHSC a annoncé que le gouvernement avait commandé 2 millions des premiers tests LFD fabriqués en Grande-Bretagne pour le COVID-19 (test SureScreen DiagnosticsLFD) afin qu'ils soient validés par le PHE.

Oxford Nanopore LamPORE
En janvier 2021, le DHSC a annoncé les résultats d'un essai portant sur la technologie de test Oxford Nanopore LamPORE utilisée dans des laboratoires pop-up pilotes. Ils ont conclu qu'elle était "très efficace" pour détecter le virus chez les personnes présentant ou non des symptômes.

L'étude pilote sur les patients asymptomatiques a recruté 1 200 professionnels de la santé dans quatre hôpitaux. Les résultats viennent s'ajouter aux études précédentes sur les patients symptomatiques. Ils sont les suivants :

• Une sensibilité de 100 % et une spécificité de 100 % pour les échantillons prélevés sur des patients symptomatiques.

• Une sensibilité de 99,6 % et une spécificité de 99,4 % pour les échantillons prélevés sur des patients asymptomatiques.

• Une sensibilité de 98,9 % et une spécificité de 99,4 % pour les échantillons de salive provenant de patients asymptomatiques.

Si vous devez réserver un test d'accès rapide sur écouvillon COVID-19, vous pouvez être rassuré : les tests proposés sur Patient Access ne comprennent que les marques ci-dessus, qui ont été approuvées par PHE et/ou ont été choisies pour être utilisées dans le NHS.

Dois-je faire un test d'écouvillonnage COVID-19 ?

Le test PCR au sein du NHS

Si vous présentez des symptômes possibles de coronavirus, vous devez vous auto-isoler et réserver un test via le site web du NHS. Le test standard d'écouvillonnage pour l'infection actuelle disponible sur le NHS est un test PCR. Il est disponible pour les personnes de tout âge en Angleterre et au Pays de Galles présentant des symptômes de coronavirus, ou pour toute personne en Écosse ou en Irlande du Nord âgée de plus de 5 ans présentant des symptômes de coronavirus.

Si vous avez été doublement vacciné contre le COVID-19, vous ne devez plus vous auto-isoler si vous avez été identifié comme un contact proche d'une personne atteinte du COVID-19. Toutefois, vous devez effectuer un test PCR dès que possible et, idéalement, vous isoler jusqu'à ce que vous obteniez un résultat négatif. Si le résultat est positif, vous devez vous auto-isoler pendant au moins 10 jours à compter de la date du test.

Tests de flux latéral sur le NHS

Les tests LFD sont désormais largement disponibles pour les étudiants et les enseignants des écoles secondaires, des collèges et des universités. Vous pouvez également obtenir des tests LFD gratuits dans les pharmacies participantes ou en ligne.

Ces tests ne permettent pas de certifier que vous n'êtes pas infecté si vous voyagez à l'étranger et ne doivent pas être utilisés si vous présentez des symptômes. Toutefois, ils donnent une bonne indication de l'infection si vous ne présentez pas de symptômes et peuvent vous rassurer sur le fait que vous ne transmettez pas le virus à d'autres personnes sans le savoir.

Tests d'écouvillonnage privés

Si vous voyagez à l'étranger, vous devrez peut-être passer un test PCR ou LFD avant votre départ ou à votre retour. Ces tests ne sont pas disponibles dans le cadre du système national de santé. Les tests PCR et LFD adaptés aux voyages sont largement disponibles dans les pharmacies et vous pouvez réserver un test privé directement sur Patient Access. Les pharmacies qui proposent des tests sur écouvillon par l'intermédiaire de Patient Access n'offrent que des écouvillons approuvés par le PHE, le DHSC ou un autre organisme national.

Il est très important de ne pas réserver un test d'écouvillonnage privé si vous présentez des symptômes d'une éventuelle infection par le COVID-19. Les centres de test du NHS sont entièrement équipés de mesures de contrôle des infections qui ne sont pas disponibles dans les pharmacies.

Le bilan

Il est très important de se rappeler qu'aucun des tests existants n'est sensible à 100 %. De plus, ils ne donnent qu'un aperçu de la présence d'un virus dans le nez et/ou la gorge au moment précis où l'échantillon est prélevé. En outre, un test auto-administré a beaucoup moins de chances d'être précis qu'un test effectué par un professionnel de la santé qualifié.

Toutefois, si vous êtes infecté mais que votre charge virale est très faible, vous avez probablement beaucoup moins de chances d'être contagieux, c'est-à-dire de transmettre le virus à d'autres personnes, même si vous êtes infecté. Bien que les tests d'accès rapide les plus fiables soient légèrement moins sensibles que la PCR, ils ont presque autant de chances d'être positifs que la PCR si la charge virale est élevée, c'est-à-dire si vous êtes très contagieux.